國共論壇舉行前夕，國安人士從26日起連續兩天在特定媒體放話，將論壇與國民黨擋國防特別預算綁在一起；27日，一名隨團的國立大學系主任申請赴陸，被主管機關打回票。對此，國民黨副主席蕭旭岑28日呼籲賴總統約束手下，不要破壞兩岸交流；他指出，這也證明民進黨擔心國民黨改善兩岸關係。
蕭旭岑在「兩岸交流合作前瞻論壇」行前記者會上指出，《自由時報》連續兩天的報導方向完全不一樣，第一天說國民黨因為阻擋軍購不力，所以北京推遲論壇，第二天又說因為國民黨阻擋軍購有力，所以下週就要舉辦論壇，請問這樣的媒體報導民眾還相信嗎？
《自由時報》提到的「統一後再無中華民國」，蕭旭岑說，都是編故事，這次論壇前國共已經磋商幾個月，縝密地討論各項兩岸關係議題，但絕對沒有上述政治性的議題；他譴責所謂「國安人士」躲在媒體背後放話編造故事，搞認知作戰。
蕭旭岑呼籲民進黨政府高抬貴手，讓台灣老百姓真正關心的民生、經濟、科技、防災等議題能透過兩岸交流，得到大陸更多的協助跟回饋，這也是國民黨舉辦此次論壇的初衷。
綠媒還說，國民黨擋了國防特別預算，才取得在北京舉辦國共論壇的「門票」，蕭旭岑反諷，中國國民黨跟大陸交流需要「門票」嗎？國共雙方有共同的政治基礎，堅持九二共識，反對台獨；過去，從連戰、朱立倫、洪秀柱、吳伯雄，乃至馬英九前總統到中國大陸交流，那一次用軍購來作為「門票」？
蕭旭岑呼籲賴總統，約束下面的國安人士，不要破壞兩岸交流；從《自由時報》的報導可以看出，綠營很怕中國國民黨成功地協助兩岸交流、協助台灣產業、爭取台灣民眾利益，所以他們才會編造這些故事。
蕭旭岑表示，國民黨已經正式提告《自由時報》。
蕭旭岑強調，軍購要嚴審，因為國民黨要為台灣老百姓看緊荷包，這跟國民黨今年推動兩岸交流是兩回事，而事實會證明這一切。
蕭旭岑證實，國共論壇的消息曝光之後，隨團的專家學者有人就受到相關單位的關切，還有人因此臨時取消隨團。